NHNN đã phối hợp với Ngân hàng quốc gia Campuchia (NHQG) chỉ đạo các ngân hàng thương mại (NHTM) hai nước mở rộng các hình thức thanh toán phục vụ doanh nghiệp hai nước trong thanh toán xuất nhập khẩu, đồng thời khuyến khích các NHTM hai nước mở thêm các chi nhánh dọc khu vực biên giới hai nước và đầu tư thêm những thiết bị hiện đại phục vụ cho công tác thanh toán được nhanh hơn thuận lợi hơn.

Để tăng cường quan hệ hợp tác giữa NHTW hai nước, Thống đốc NHQG Campuchia và Thống đốc NHNN Việt nam đã luân phiên thăm viếng lẫn nhau để trao đổi kinh nghiệm trong việc điều hành chính sách tiền tệ và tìm biện pháp thúc đẩy quan hệ hợp tác giữa hai bên. Tháng 12/2008, Thống đốc NHQG Campuchia đã sang thăm Việt Nam. NHTW hai nước đã ký kết Bản ghi nhớ về trao đổi thông tin thanh tra giám sát ngân hàng.